Факультет ординатуры и магистратуры является структурным подразделением ТГМУ, основной задачей которого является методическое сопровождение и реализация программ высшего образования по направлениям подготовки: Высшее образование — программы подготовки кадров высшей квалификации в ординатуре (квалификация врач-специалист) по соответствующим специальностям. Высшее образование — программы подготовки второй ступени в магистратуре (квалификация магистр).