В Инженерно-технологическом институте используются технологии обучения, позволяющие подготовить профессионалов высокого уровня. Среди студентов, сотрудников и выпускников Института информатики и телематики более 80 Сертифицированных специалистов Майкрософт, мирового лидера в области системного и прикладного программного обеспечения.

В состав Института сегодня входит 8 кафедр (из которых 8 являются выпускающими), ведущих подготовку по 15 специальностям и направлениям высшего (очного и заочного) и послевузовского профессионального образования.

Институт искусств реализует образовательные программы среднего и высшего профессионального образования. Цель: реализация образовательных программ среднего, высшего, послевузовского и дополнительного образования в области культуры и искусства, народного художественного творчества, образования в области культуры и искусства; подготовка научно-педагогических кадров высшей квалификации, повышение квалификации преподавательского состава и др.

Институт истории и права был образован приказом ректора № 371 от 23 февраля 1998 г. путем реорганизации факультета экономики и права и исторического факультета. В состав института входят восемь кафедр; Музей истории, археологии и этнографии; Юридическая клиника; Криминалистическая лаборатория.

Институт непрерывного педагогического образования ведет свою историю с открытия кафедры педагогики в Абаканском учительском институте в 1939 году. С этого момента начинается подготовка учителей начальных классов. В 1989 году открывается кафедра дошкольного воспитания в структуре факультета дошкольного воспитания. Далеко опередив многие вузы России, институт начал подготовку специалистов для раннего обучения иностранным языкам детей дошкольного возраста.

В структуре института: Кафедра зарубежной лингвистики и теории языка; Кафедра иностранных языков и методики преподавания; Кафедра русского языка и литературы; Кафедра стилистики русского языка и журналистики; Кафедра хакасской филологии.

В структуре института: Кафедра менеджмента; Кафедра экономики; Кафедра философии и культурологии.

Медико-психолого-социальный институт (МПСИ) Хакасского государственного университета им. Н.Ф. Катанова является учебным, научным, административным, структурным подразделением ХГУ им. Н.Ф. Катанова, реализующий образовательные программы разных уровней (ступеней).

Кафедры и подразделения:кафедра агрономии; кафедра морфологии и физиологии животных; кафедра инфекционных и незаразных болезней животных; сельскохозяйственный колледж.