Институт начал свою историю в 1919 году как лечебный факультет Самарского государственного университета. В настоящее время институт является ведущим в вузе по количеству студентов и осуществляет подготовку врачей по специальности «Лечебное дело». В институте обучаются 2700 студентов не только из Самарской области, но и из многих других регионов страны и зарубежья.

Все клинические кафедры расположены в многопрофильных лечебно-профилактических учреждениях (Самарская областная детская клиническая больница им. Н. И. Ивановой, областная клиническая больница им. В. Д. Середавина, областной клинический кардиологический диспансер, областная детская инфекционная больница и многие другие), оснащены современной техникой.

Институт профилактической медицины (Institute of Preventive Medicine) представляет собой крупный центр реализации образовательной, научной и лечебной деятельности в сфере превентивной медицины. Специалисты высокого класса, которых выпускает институт, востребованы не только в стране, но и за рубежом.

В настоящее время институт реализует все уровни подготовки специалистов: среднее специальное образование, высшее профессиональное образование, последипломное образование специалистов как с высшим, так и со средним медицинским образованием.

В 1991 году Самарский государственный медицинский университет первым среди медицинских вузов страны приступил к подготовке нового специалиста — клинического психолога. В соответствии с федеральным государственным образовательным стандартом выпускнику факультета присваивается квалификация «Психолог. Клинический психолог. Преподаватель психологии».

Институт стоматологии открыт в 1966 году. В институте стоматологии имеются специальные кафедры: терапевтической стоматологии, челюстно-лицевой хирургии и стоматологии, ортопедической стоматологии и кафедра стоматологии детского возраста и ортодонтии. Кроме того, имеется кафедра стоматологии ИПО, где проводится последипломное обучение с выдачей сертификата специалиста.

Институт фармации Самарского государственного медицинского университета был открыт в 1971 году. На старших курсах преподаются профильные дисциплины: фармакогнозия, технология лекарств, фармацевтическая химия, управление и экономика фармации, фармацевтический маркетинг и менеджмент, основы законодательства в фармации, фармацевтическая информация, что позволяет готовить специалистов для работы в современных экономических условиях.