Образовательный процесс по специальности «Лечебное дело» обеспечивается на 36 кафедрах — 15 теоретических и 21 клинической. Подготовка будущих врачей осуществляется высококвалифицированными научно-педагогическими кадрами: профессорами, доцентами, заслуженными деятелями науки РФ, заслуженными работниками здравоохранения, заслуженными работниками высшей школы.

Подготовка врачей-педиатров с 2011 года осуществляется в соответствии с требованиями Федерального государственного образовательного стандарта высшего профессионального образования по направлению подготовки (специальности) Педиатрия. После окончания академии выпускники могут специализироваться по детской хирургии, детской неврологии, детской гинекологии и другим специальностям педиатрического профиля.

Стоматологический факультет по праву является одним из самых приоритетных и перспективных подразделений академии, на развитие и модернизацию которого затрачиваются значительные материальные и интеллектуальные ресурсы.