Естественно-технологический институт (ЕТИ) является одним из старейших подразделений МГТУ, его история начинается ещё в 1980 году, с создания Технологического факультета в Мурманском высшем инженерном морском училище им. Ленинского комсомола. Сегодня это современный развивающийся институт, где обучаются около 650 студентов

С 1 сентября 2002 года в университете образовано структурное подразделение — Морская академия МГТУ — с включенными в ее состав факультетами: cудоводительским; cудомеханическим; факультетом повышения квалификации. В сентябре 2015 года приказом ректора Морская академия была переименована в Морской институт.

Институт арктических технологий образован c 1.09.18 г. путем преобразования из Факультета арктических технологий. Структура направлений института в основном связана с подготовкой кадров в области жизнеобеспечения региона. В Мурманской области, как и в любом другом регионе, представлены энергетика — тепловая и электрическая, транспортный комплекс, во всех сферах широко применяются информационные технологий, на предприятиях эксплуатируются и внедряются автоматизированные системы управления.